Les relations entre la Suisse et la Tunisie se sont développées au 19e siècle pendant l'expansion française en Afrique du Nord. En 1939, la Suisse a ouvert un consulat à Tunis. A cette époque, environ 400 Suisses vivaient en Tunisie, essentiellement des agriculteurs, des commerçants, des employés et des représentants des Eglises. Entre 1939 et 1943, la Suisse a représenté les intérêts italiens en Tunisie. Le consul suisse garantissait la protection de la colonie italienne, qui comptait environ 120 000 personnes, et organisait des rapatriements.

La Tunisie a acquis l'indépendance en 1956. La Suisse a immédiatement reconnu le nouvel Etat et ouvert une mission (devenue ambassade en 1961). Il y a eu de nombreuses violences lors du détachement de la Tunisie de la France. Une partie des quelque 570 ressortissants suisses installés en Tunisie a donc quitté le pays. Dès 1957, la Confédération, en collaboration avec le Comité international de la Croix-Rouge (CICR), a soutenu les réfugiés algériens en Tunisie. Par la suite, la Suisse s'est engagée dans les secteurs de l'éducation et du tourisme. La Tunisie est aujourd'hui une des destinations touristiques favorites des Suisses.

Les relations économiques entre les deux pays sont importantes. Preuve en est notamment l'accord de libre échange signé fin 2004 à Genève par l'Association européenne de libre échange (AELE) et la Tunisie. De nombreuses entreprises suisses sont actives en Tunisie notamment dans les secteurs du textile, des vêtements et des produits alimentaires. La Suisse et la Tunisie ont organisé en commun le Sommet mondial de la société d'information dont la première partie a eu lieu en 2003 à Genève et la deuxième partie en 2005 à Tunis. Les relations bilatérales entre les deux Etats sont parfois affectées par des positions divergentes en matière de respect des droits de l'homme.