Outre les grands secteurs qu’elle soutient, la Suisse se préoccupe aussi d’autres enjeux, comme ceux liés aux disparités de genre et à la production culturelle.
Malgré l’adoption, en 2009, d’une Politique Nationale Genre, force est de reconnaître qu'il n'y a pas de véritable égalité entre les sexes au Burkina Faso. Cette situation relève autant du contexte socioéconomique que du poids des traditions. Aujourd’hui encore, une fille sur deux ne va pas à l’école et près de 80% des femmes sont analphabètes. Dès lors, les femmes sont particulièrement exposées à la pauvreté et à la marginalisation.