Au cours des dernières années, les relations commerciales de la Suisse et de la Slovénie ont connu un bel essor. Le volume des échanges a progressé en moyenne de 80,4 % par an entre 2018 et 2023, année où il s'est monté à 27,8 milliards de francs, faisant de la Slovénie le sixième partenaire commercial le plus important de la Suisse à l'échelle mondiale.
Depuis 2022, la Suisse est le principal partenaire de la Slovénie et figure, selon le Fonds monétaire international, au troisième rang des investisseurs étrangers. Sa part dans les investissements étrangers se monte à 11,3 %, pour un montant de 2,4 milliards de francs. La qualité des relations entre les deux pays ne se limite toutefois pas au commerce et aux investissements : Berne et Ljubljana sont également étroitement liées dans le domaine de la recherche et de la formation.
La progression notable des échanges entre les deux pays s'explique principalement par les initiatives stratégiques lancées par l'industrie pharmaceutique suisse en Slovénie. On peut citer à ce titre les investissements productifs dans des produits à très forte valeur ajoutée, l'amélioration de l'efficacité de centres de distribution pour l'importation, l'exportation et le transit des médicaments et la contribution considérable de l'industrie pharmaceutique suisse en faveur du trafic de perfectionnement.
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