Im Bereich Forschung arbeitet die DEZA in der Schweiz insbesondere mit folgenden Partnern zusammen:
- Universitäten
- Eidgenössische Technische Hochschulen (ETHZ und EPFL)
- Fachhochschulen
- Hochschulinstitut für internationale Studien und Entwicklung (IHEID)
- Schweizerisches Tropen- und Public Health Institut (SwissTPH)
- Wyss Academy for Nature
- Schweizerischer Nationalfonds zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung (SNF)
- Akademien der Wissenschaften Schweiz, insbesondere die Akademie der Naturwissenschaften (SCNAT)
- Kommission für Forschungspartnerschaften mit Entwicklungsländern (KFPE)
- Staatssekretariat für Bildung, Forschung und Innovation (SBFI)