Le gouvernement portugais a reconnu la neutralité de la Suisse en 1815. Les relations consulaires entre les deux pays datent de cette époque, même si le premier accord en ce sens n’a été signé qu’en 1883.
En 1817, la Suisse a ouvert un consulat à Lisbonne, transformé en consulat général en 1874. Puis, en 1936, la Suisse a ouvert dans la capitale portugaise une chancellerie diplomatique, qui devint légation en 1945, avant d’être élevée au rang d’ambassade en 1959. Le Portugal a ouvert son premier consulat en Suisse en 1855, à Genève. Berne accueille une légation portugaise depuis 1892, qui est devenue une ambassade en 1959.
L’appartenance des deux pays à l’Association européenne de libre-échange (AELE) a favorisé leurs relations entre 1960 et 1985. De 1963 à 1975, la Confédération a représenté les intérêts portugais au Sénégal.
À partir de 1977, les visites mutuelles se sont intensifiées. En 2003, le président de la Confédération Pascal Couchepin a effectué une visite officielle au Portugal; le conseiller fédéral Samuel Schmid lui a emboîté le pas en 2004 et en 2006, de même que la présidente de la Confédération Micheline Calmy-Rey en 2007. Les 17 et 18 octobre 2016, le président Marcelo Rebelo de Sousa s’est rendu en Suisse pour une visite d’État, suivie les 28 et 29 novembre 2017 d’une visite d’État à Lisbonne de la présidente de la Confédération Doris Leuthard.
Portugal, Dictionnaire historique de la Suisse