La Suisse a reconnu le Tadjikistan le 23 décembre 1991, après l’effondrement de l’Union soviétique. Les deux pays ont établi des relations diplomatiques le 9 décembre 1992. Relevant dans un premier temps de l’Ambassade de Suisse à Moscou, elles ont été confiées, à partir de 1994, à l’ambassadeur de Suisse en poste à Tachkent (capitale de l’Ouzbékistan), qui était également accrédité à Douchanbé. Depuis 2008, elles relèvent de la compétence de l’ambassadeur de Suisse au Kazakhstan.
La Suisse a ouvert un bureau de coopération à Douchanbé en 1998. Ce bureau assume également des tâches consulaires depuis 2001.
La coopération internationale de la Suisse au Tadjikistan remonte à la mission d’aide humanitaire mise en place en 1993 pendant la guerre civile. Depuis 1997, le Tadjikistan fait partie du groupe de pays menés par la Suisse au sein des institutions de Bretton Woods.
Le Tadjikistan a décidé en 2007 d’élever son bureau de Genève au rang de mission. Depuis 2011, il dispose d’un ambassadeur accrédité en Suisse.
Tadjikistan, dictionnaire historique de Suisse