Die Schweiz unterhält eine Botschaft in Kuala Lumpur, für die konsularischen Angelegenheiten ist jedoch die Schweizer Botschaft in Bangkok (Thailand) zuständig. Malaysia verfügt über eine Botschaft in Bern, ein Generalkonsulat in Genf sowie Konsulate in Basel und Zürich.
Die Schweiz und Malaysia unterhalten seit 1963 diplomatische Beziehungen.
Malaysische Staatsangehörige sind von der Schweizer Visumspflicht befreit, dies gilt im südostasiatischen Raum sonst lediglich für singapurische Staatsangehörige.
Die Europäische Freihandelsassoziation (EFTA), der auch die Schweiz angehört, und Malaysia haben 2025 Verhandlungen über ein Wirtschaftspartnerschaftsabkommen abgeschlossen.
Die Schweiz und Malaysia arbeiten auch im Rahmen des Verbands Südostasiatischer Nationen (ASEAN) zusammen, wo die Schweiz seit Juli 2016 den Status als sektorielle Dialogpartnerin innehat. Malaysia war 1967 eines der fünf Gründungsländer der ASEAN.
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