Die Schweiz anerkannte am 23. Dezember 1991, nach der Auflösung der Sowjetunion, die Unabhängigkeit Tadschikistans. Die beiden Länder nahmen am 09.12.1992 diplomatische Beziehungen auf. Zuerst war die Schweizer Botschaft in Moskau für die zentralasiatische Republik zuständig, ab 1994 die Schweizer Botschaft in Taschkent und seit 2008 die Schweizer Botschaft in Astana.
1998 eröffnete die Schweiz ein Kooperationsbüro in Duschanbe.
Die IZA der Schweiz in Tadschikistan begann mit einem Einsatz der Humanitären Hilfe 1993 während des Bürgerkriegs. 1997 wurde Tadschikistan Mitglied der von der Schweiz angeführten Stimmrechtsgruppe in den Bretton-Woods-Institutionen.
2007 wertete Tadschikistan sein Büro in Genf in eine Mission auf. Seit 2011 hat Tadschikistan einen akkreditierten Botschafter in der Schweiz.
Historisches Lexikon der Schweiz: Tadschikistan